마크에 담긴 붉은색은 태양ㆍ목표, 푸른색은 바다ㆍ젊음을 의미합니다. 또한 가운데 징표는 거북선을 상징하며, 이는 옥포만에 서려있는 충무공의 정신을 계승하고자 함입니다.좌우의 선은 거북선의 노를 표현함으로써 젊음과 패기로 목표를 향해 힘차게 전진하는 거제옥포고 학생을 상징합니다.
소나무는 우리나라 전지역에서 자생하며 지역간 화합과 민족의 통일, 무궁한 번영과 발전의 역사성을 지닌 소나무는 어떤 역경 속에서도 푸르름을 잃지 않는 꿋꿋한 절개와 곧은 의지를 상징합니다.
매화는 이른 봄 추위를 무릅쓰고 제일 먼저 피어나는 꽃으로, 맑은 품성과 인내, 굽힐 줄 모르는 정조와 결백의 선비 정신을 상징합니다.